Přestože je nyní aplikace postavena na robustním SQL databázovém systému, nelze případný vznik chyb zcela vyloučit. Proto je důležité pravidelně zálohovat databázi. Kontrolu integrity struktury databáze lze spustit z libovolného klientského počítače.
Možnost poškození databáze bude minimalizována provozováním databázového serveru kombinované s použitím záložního zdroje napájení na tomto systému. Tato opatření nemusí být použita na žádném klientovi, protože pád klienta neovlivní práci serveru. Databázový server totiž po určitém časovém úseku testuje spojení klientů a pokud některý klient z důvodu pádu systému nepotvrdí do určité doby spojení, databázový server ukončí toto spojení a rovněž ukončí veškeré transakce spuštěné v kontextu tohoto spojení. V případě zjištění porušení integrity databáze je možné použít aplikace dodávané s SQL serverem (gfix.exe nebo IBOConsole), nebo automatické zálohování a obnovení databáze v aplikaci EVOK označené jako restrukturalizace databáze.
